公司发现过期食品，老板从我的工资中扣除500元

不合法，公司无权随意扣款。依据《劳动法》，单位不得无故克扣员工工资，几块钱过期食品不应扣500元。若不及时处理，可能影响员工权益，造成劳动关系紧张。
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常见处理方式为协商或仲裁。首先尝试与老板沟通解决，若协商无果，则向当地劳动仲裁院申请仲裁，根据《劳动法》维护自身权益，选择合适方式以有效解决问题。
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不合法。处理方式：1.与老板协商，说明扣款不合理，要求恢复工资；2.若协商不成，收集证据，如工资条、扣款通知等；3.向劳动仲裁院提交仲裁申请，附上证据材料；4.等待仲裁结果，若不服可进一步诉讼。